反渗透系统的使用，特别是应注意的原水预处理。为了避免反渗透系统的堵塞，水应进行预处理，消除水中的悬浮物，降低水的浑浊度;此外，它应消毒以防止微生物生长的成长。由于原水中悬浮泥沙的高要求，通常采用水质检测的水质。这种方法基本上是一个用于反渗透系统中的水悬浮固体的测定的情况下。水进入反渗透设备的污染指数不超过5，推荐值一般小于3。
在预处理过程中应考虑进水PH值。各种半透膜都有其适宜的运行pH值，所以根据反渗透膜的要求，调节进水pH值。预处理应考虑温度。水的水含量随温度的升高而增加，但温度过高，会加快纤维素膜的水解速率，使有机膜变得柔软，易于压实。因此，对于有机薄膜，温度控制适用范围为20～40，复合膜的温度适用范围为5～45。
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