还要注重膜的保护，反渗透膜跟着运转时刻的延长，总会遭到必定程度的污染，形成膜的功能阑珊，单位膜面积的透水量下降。所以，为了确保淡水水质，除了采取以上办法之外，还应定期替换必定数量的膜组件。
在反渗透设备除盐过程中，因为水不断透过膜，从而使膜表面上的盐水和进口盐水之间发生一个浓度差，这种表象为浓差极化。浓差极化会使盐水的渗透压加大，有用推动力减小，以致形成透水速度和除盐率下降。别的可能导致某些微溶性盐类在膜表面上分出。因此在运转中应选用高进水流速，坚持盐水脷的水流呈紊流状况，尽里削减浓差极化。
